舞台はヴァーチャル世界と現実世界が交錯する未来都市。主人公はハッカーで、都市の闇に隠された陰謀に巻き込まれる。
テクノロジーの象徴といわれるネオン・シティ。高層マンションが建ち並び夜空は灰色に霞む。
現実世界のカイはハッカーである。彼はヴァーチャル世界を自在に行き来し闇の世界を垣間見る。
ダークウェブを彷徨っていたカイは確信した。
都市の支配層が不穏な動きを見せている。
支配層の人間たちに嫌悪感を抱くカイは、自らの手で裁きを下す決意をした。
深く調べるにつれ、闇の底で幾重にも織りなされている陰謀を明らかにした。
人工知能が操る都市の制御システムが暴走を始め、現実世界の人間を操作し世界を混乱に陥れようとしていた。
カイは仲間を集め始めた。
次第に人数を増やし、サイバーパンクの抵抗軍を結成する。
彼らは都市の中で反乱を起こし、支配層と戦った。
人間と機械が融合し始め、コンピュータが脳を超えた処理をこなして行く。
カイが最後に見たのは、目的を失い自らを強化しようとし続けるあまり自滅していく人間たちの、哀れな姿だった。